La directive de configuration d'apache SSLCertificateChainFile est maintenant dépréciée (à partir d'apache 2.4.8) pour spécifier un certificat intermédiaire.
Le message d'avertissement nous demande de la remplacer par la directive SSLCertificateFile. Le problème est que cette directive est déjà renseignée avec notre certificat. La solution est triviale:
concaténer les deux fichiers
cat ssl.crt sub.class1.server.ca.pem > bundle.pem
faire pointer la directive SSLCertificateFile sur celui-ci.
SSLCertificateFile bundle.pem